按我国现行增值税的减免规定，减免增值税分为先征收后返回、即征即退、直接减免三种形式。因此，其会计处理也有所不同。
　　（一）先征收后返回、即征即退增值税的会计处理1.按指定用途返回的会计处理。
　　（1）用于新建项目。
　　实际收到返回的增值税税款时，直接转作国家资本金。作会计分录如下：
        借：银行存款 
            贷：实收资本——国家投入资本 
        （2）用于改建扩建、技术改造。
        收到返还的增值税税款时，视同国家专项拨款。作会计分录如下：
        借：银行存款 
            贷：专项应付款——××专项拨款
        实际用于工程支出时，作会计分录如下：
        借：在建工程——××工程 
            贷：银行存款等
        工程完工，报经主管财政机关批准，对按规定予以核销的部分（不构成固定资产价值），作会计分录如下：
        借：专项应付款——××专项拨款 
            贷：在建工程
         对构成固定价值的部分，作会计分录如下：
        （3）用于归还长期借款。 
        经批准归还长期借款，即“贷改投”时，可转为国家资本金。作会计分录如下：
        借：银行存款
             贷：实收资本——国家投入资本
        借：长期借款
             贷：银行存款
        2.返还进口增值税（即征即退）的会计处理。
        国家根据需要，可以规定对进口的某些商品应计征的增值税采取即征即退的办法，退税额冲减采购成本，退税的直接受益者必须是以购进商品从事再加工的生产企业。
     ［例1］某外贸企业进口原棉一批，进口棉花所征增值税实行即征即退办法。该批棉花价值折合人民币500000元，应交增值税85000元。作会计分录如下：
        外贸企业入账时：
        借：应交税金——应交增值税（进项税额）　85000
            贷：应付账款或银行存款等　585000
        收到进口商品退税款时：
        借：银行存款　85000
            贷：应付账款——待转销进口退税　85000